公司是由原中国民航安徽省管理局属地化移交改制成立的唯一省属民航企业。

2003年，民航安徽省管理局实行政企分离属地化移交改制，撤销民航安徽省管理局，合肥、黄山机场移交安徽省政府管理，组建安徽民航机场管理有限公司。2005年，引入省高速公路总公司（现省交控集团）作为合作伙伴，实现股权多元化，组建安徽民航机场集团有限公司。2015年经省国资委批复，机场集团原法人股东省交控集团撤股，变更为国有独资公司。2017年根据省国资委企业功能和分类方案定为公益类省属企业。以机场航空性保障业务和其他航空运输辅助活动为主营业务，同时紧紧依托主业，积极发展航空配餐、机场建设、广告经营、候机楼商贸、酒店餐饮等多项经营业务。