学会成立于1981年7月，是在北京市民政局注册的具有独立法人资格的社会团体，业务主管单位为北京市科学技术协会，行政主管单位为北京市中医管理局，总会为中国中西医结合学会。

学会的办会宗旨是积极团结广大医务工作者为繁荣和发展北京地区的中医、中西医结合事业而搭建学术交流平台、培养人才、进行成果推广，为宣传中医药文化而对市民进行科普宣传活动。